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科学家使用澳大利亚同步加速器识别冠状病毒蛋白结构

2020-04-13 15:13          同步加速器 粒子加速器

中国核技术网讯:澳大利亚核科学技术组织(ANSTO)在4月7日表示,莫纳什大学的研究人员已经确定了新冠状病毒中一种蛋白质的结构,该蛋白可用于筛选潜在的治疗药物。

研究人员使用澳大利亚同步加速器上的大分子结晶学束线,以原子分辨率确定了SARS-CoV-2蛋白的3D结构。

澳大利亚同步加速器于2007年在维多利亚州墨尔本正式启动。

3GeV国家同步加速器辐射设施是南半球最大的粒子加速器,可满足澳大利亚主要大学、研究中心和企业的研究需求。2015年,澳大利亚政府宣布通过ANSTO,进行为期10年的5.2亿澳元(3.24亿美元)投资。

SARS中的Nsp9蛋白与来自COVID-19的对应蛋白有97%的序列相同。研究人员克隆了一种CoV-19 Nsp9蛋白用于实验。这些结构在发表在bioRxiv杂志上的一篇论文中进行了描述,可以潜在地用于药物筛选和靶向实验中,以破坏病毒的复制。

新型冠状病毒仅产生27种左右的蛋白质。科学家试图了解如何防止这些蛋白质在我们细胞内的产生。

研究人员Dene Littler博士在莫纳什大学医学院生物医学发现研究所的Jamie Rossjohn教授的实验室内,研究了SARS-CoV-2产生的一些不太了解的蛋白质。

其中之一,非结构蛋白9(Nsp9)被认为在RNA结合中起作用,众所周知,SARS中该蛋白的相关版本对于病毒基因组的复制很重要。

Rossjohn说:“这代表了Monash加速研究计划的开始,该计划旨在开发新的抗病毒治疗以及了解免疫系统如何对抗这种病毒。”

利特勒说:“这将是世界科学家开发一种专门针对日冕病毒蛋白的全新药物的广泛战略的一部分,这种新药物将阻断这种病毒在人细胞中感染和繁殖的能力。”

“诸如引起普通感冒的病毒之前没有足够的健康影响,因此无法进行大规模的药物研究计划。但是,面对当前的大流行,情况已经明显改变,我们正在玩赶上快节奏的追赶游戏。”

澳大利亚同步加速器可快速跟踪微焦点晶体学光束线(MX2),以进行COVID-19相关研究。

使用新的MX2光束线上的ACRF检测器,大约需要18秒钟来获取数据集,然后将其用于快速构建Nsp9的晶体结构。”主要科学家Alan Riboldi-Tunnicliffe博士说。

他补充说,MX2具有强大的窄光束,这使研究人员可以专注于晶体的特定部分,并观察关键的相互作用,例如结合。

为响应COVID-19危机,澳大利亚同步加速器一直保持MX2光束线正常运行。研究人员可以将样品发送到同步加速器并远程使用该仪器。同步加速器已从澳大利亚,新加坡和中国收到了与CoVID-19有关的样品。



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